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合肥工業(yè)大學(xué)農(nóng)產(chǎn)品加工研究院師資隊(duì)伍為主要研究團(tuán)隊(duì),研究方向包括農(nóng)作物功能基因分離鑒定、表達(dá)調(diào)控機(jī)制與作物遺傳改良、禽畜類(lèi)動(dòng)物功能基因組學(xué)、農(nóng)產(chǎn)品功能成分分離分析及應(yīng)用新方法、畜產(chǎn)品深加工及品質(zhì)光譜快速分析、天然產(chǎn)物化學(xué)、功能食品及其加工、食品微生物代謝調(diào)控及生物質(zhì)原料發(fā)酵利用、真菌學(xué)與資源微生物學(xué)等,涵蓋農(nóng)產(chǎn)品及加工上、下游主要技術(shù)環(huán)節(jié)。研究中心也與宣城校區(qū)“化工與食品加工系”,“機(jī)械工程系”,“信息工程系”和“基礎(chǔ)部”,以及合肥校本部食品科學(xué)與工程學(xué)院科研人員有著密切的合作。